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第1集 - 虚伪的和平
第2集 - 其名为高达
第3集 - 崩坏的大地
第4集 - 静音潜航
第5集 - 相转移装甲失效
第6集 - 消失的高达
第7集 - 宇宙的伤痕
第8集 - 敌军的歌姬
第9集 - 消失的光明
第10集 - 分歧的道路
第11集 - 觉醒的利刃
第12集 - 芙蕾的选择
第13集 - 宇宙星降
第14集 - 在无尽的时光中
第15集 - 各自的孤独
第16集 - 燃烧的沙尘
第17集 - 再逢卡嘉丽
第18集 - 报复
第19集 - 宿敌的獠牙
第20集 - 平稳的日子
第21集 - 砂尘的尽头
第22集 - 染红的大海
第23集 - 命运的邂逅
第24集 - 只有两个人的战争
第25集 - 通往和平之国
第26集 - 时机
第27集 - 无止尽的轮舞
第28集 - 基拉
第29集 - 命运之楔
第30集 - 闪光的时刻
第31集 - 恸哭的天空
第32集 - 约束之地
第33集 - 闇的胎动
第34集 - 放眼所见
第35集 - 飞天翔舞之剑
第36集 - 以正义为名
第37集 - 神之怒
第38集 - 决意的炮火
第39集 - 阿斯兰
第40集 - 破晓的宇宙
第41集 - 动乱的世界
第42集 - 拉克丝出击
第43集 - 大敌当前
第44集 - 螺旋的邂逅
第45集 - 开启的门扉
第46集 - 灵魂的场所
第47集 - 恶梦再现
第48集 - 愤怒之日
第49集 - 终末之光
第50集 - 朝向永无止尽的明日
SP1 - 星のはざまで
动漫介绍
所谓SEED，全写为Superior Evolutionary Element Destined-factor，即“高度进化要素遗传因子”。
C.E.70年，由于“血腥情人节”惨剧的发生，地球方面与P.L.A.N.T.爆发了持续近一年的战争。主角基拉·大和所在的殖民卫星“赫立奥波利斯”（Heliopolis）突遭儿时好友亚斯兰·萨拉（Athrun Zala）所属的Z.A.F.T.特殊部队进攻，二位男主角的重遇成为故事的开端。
P.L.A.N.T.在“血腥情人节”后发动的独立战争，其战略为先将“中子干扰器”散布在地底下，引发地球上的能源危机，再以新型兵器MS逐步攻下在赤道附近的质量投射器，以将地球联合军封锁在地球内，再也无法威胁P.L.A.N.T.。由于此情况貌似神话中自食其尾的大蛇，故命名为Operation Ouroboros作战。战争爆发初期，无人怀疑过联合军将以压倒性的兵力和资源迅速结束战争，然而战争胶着了十一个月，战况却是对联合军愈来愈不利；其主要原因之一就是联合军拿Z.A.F.T.的新型兵器MS一点办法也没有。
战争后期，Operation Ouroboros作战的最后目标原为地球联合军所剩唯一的质量投射器所在地巴拿马宇宙港，但由于P.L.A.N.T.最高评议会议长由主和的希捷尔·克莱因改为主战的帕特里克·萨拉，故目标被改为联合军位于阿拉斯加的总部JOSH-A。虽然最后成功攻陷JOSH-A，但Z.A.F.T.却也中了埋伏失去过半兵力。后来Z.A.F.T.以少数兵力强行攻陷巴拿马，但最终仍被已建立了MS部队的联合军夺回质量投射器重上宇宙。
回到宇宙的联合军以核武攻陷P.L.A.N.T.的前线要塞波亚兹，即将直取P.L.A.N.T.首都。而Z.A.F.T.亦在最后的宙域“亚金‧杜威”投入剩余兵力展开防卫战，这场最终决战的结果是......
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续集
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状态： 完结 类型：机战 科幻简介：C.E.70年，由于“血腥情人节”惨剧而发展成为正式的武力冲突，Z.A.F.T.与地球联合之间的战斗炽烈之极、牺牲之巨，扩大至第二次雅金·杜威攻防战后双方缔结停战条约，方才平息；然而，此一停战条约无法消去自然人与调整者纷争的火种。 这场战乱中，真‧飞鸟被卷入地球联合军对奥卜的侵攻，双亲和妹妹在逃离战火途中消失在自己眼前。悲恸欲绝地紧握著唯一的遗物‧妹妹的移动电话，头上呼啸飞去的是这场战争的元凶“机动战士敢达”。失意的他自奥卜离去，前往P.L.A.N.T.。 然后C.E.73年，他成为Z.A.F.T.的战士...。
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总集篇
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番外篇
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状态： 完结 类型：搞笑简介：『機動戦士ガンダムSEED & SEED DESTINY Fan Disc SEED SUPERNOVA』のDVDに収録されているアニメ。前半は『SEED』をモデルにした『ガンダム嫉妬』、後半は『DESTINY』をモデルにした『MISSION DD』が収録されている。キャラクターは全て2頭身で表現されているが、別にSDガンダムが出るわけではない。 『ガンダム嫉妬』 何をやってもアスランに勝てないイザークは、敗因が自分は種割れが出来ないからではないかと推測し、ディアッカを無理矢理誘い特訓に入る。結局種割れは会得できなかったが、諦めきれないイザークはアスランにビーチバレー対決を申し込む。 『MISSION DD』 アスランが離反した後のミネルバ。議長は過去にさかのぼってキラとアスランに仲たがいさせれば良いのではないかと考え、シン・ルナ・レイの三人は「ギル特製タイムスリップスティック」を使って過去へと向かうのだった。
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状态： 完结 类型：机战 科幻简介：重制版。 当年播放的画面是4:3普屏，如今的HD重制版则是16:9宽屏，并且在对画面进行了高清画质处理的基础上，还增加了原版没有新画面，部分音乐也会重新混音处理。
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衍生
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